El texto completo del error es:
Caused by: java.lang.LinkageError: JAXB 2.0 API is being loaded from the bootstrap classloader, but this RI (from jar:file:/home/jmgomez/Documents/Projects/intime/build/web/WEB-INF/lib/
jaxb-impl.jar!/com/sun/xml/bind/v2/model/impl/ModelBuilder.class) needs 2.1 API. Use the endorsed directory mechanism to place jaxb-api.jar in the bootstrap classloader. (See http://java.sun.com/j2se/1.5.0/docs/guide/standards/)
Un error que a mí me ha aparecido en multitud de ocasiones, sobretodo cuando he tenido que migrar de versión del NetBeans o del Tomcat. La solución es copiar el api del JawxWS 2.1 que incorpora el Netbeans a un directorio endorsed/ ubicado en el apache. Si este directorio no existe se debe crear. Un ejemplo:
cp /usr/local/netbeans-6.0.1/java1/modules/ext/jaxws21/api/* /usr/local/netbeans-6.0.1/apache-tomcat-6.0.16/endorsed/
Si utilizas java en vez de un servidor de aplicaciones, debes incluir esas librerías en:
$JRE_HOME/lib/endorsed
(Puede que sólo sea necesario el jaxb-api.jar)
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